Локомотивное депо "Мичуринск" основано в сентябре 1866 года.
Среди первых построек - сарай для 9 паровозов, поворотный круг для паровоза с тендером, вагонный сарай, мастерские (ныне ПК "Милорем" - бывший паровозоремонтный или локомотиворемонтный завод).
В 1893 г. построены прямоугольный корпус, в 1896 году - дом отдыха локомотивных бригад, в 1899 году - веерный корпус.
В 1958 году депо перешло с паровозной на локомотивную тягу.
С 1965 года здесь стали эксплуатироваться электровозы, а с 1967 года - электропоезда.
С 1976 года депо эксплуатирует тепловозы серии ЧМЭ-3.
Депо пережило техническую модернизацию, что позволило превратить предприятие в базовое на Юго-Восточной железной дороге по ремонту этой локомотивной серии.