Екатерина Семёновна Черненко родилась 16 декабря 1917 года на хуторе Воздвиженск Ямпольского района Сумской области на Украине.
Окончила среднюю школу № 6 в 1934 году, факультет биологии МГУ имю Ломоносова в 1939 году, аспирантуру при Плодоовощном институте им. И.В.мичурина в 1946 году.
В 1949-1990 г.г. заведовала кафедрой ботаники Мичуринского государственного педагогического института.
научные исследования посвящены изучению онтогенетических особенностей яблони корневого и стеблевого происхождения.
Автор более ста научных публикаций, в том числе книг: "Жизнь в саду" (М, 1966), "Оптыная работа с плодовыми растениями на пришкольном участке" (Тамбов, 1987), "Школьный сад" (М, 1993).
В 1980-х годах являлась председателем мичуринского городского Фонда мира.
За активную работу в Фонде награждена в 1980 году Почётной грамотой, в 1981 году - Почётной медали.
награждена нагрудным знаком "За отличные успехи в работе высшего образования СССР" (1973), Почётной грамотой алминистрации Тамбовской олбласти в1999 году.
В мичуринске проживала с 1926 году, когда её отец - известный учёный, Герой Социалистического Трёда Семён Черненко переехал в город Козлов, чтобы трудиться с известным учёным И.В.Мичуриным.
Доктор сельскохозяйственных наук (1971), профессор кафедры биологии Мичуринского государственного педагогического института (1973).
Умерла, похоронена в городе Мичуринске Тамбовской области.